基因的多效性是指一个基因可有多种生物学效应。在人类中,很多单个基因可以使一个个体表现出多种性状。其原理涉及基因的初级效应和次级效应。初级效应是指基因通过转录和翻译过程指导一条多肽链的合成,而次级效应则是由肽链所构成的蛋白质或酶所参与或控制的各种生理过程。基因的初级效应是单一的,但次级效应则可以是多方面的。一个基因异常所造成的基因产物的缺乏常常会在不同的组织内及个体不同的发育阶段引起一系列的生化代谢或组织结构的异常,使个体表现出多种性状。
基因的多效性表现为基因间的相互作用,机制是生物的一切表型都是蛋白质活性的表现,具体地说是酶的作用,而这些酶又是在基因控制下合成的。生物体的多数性状是许多酶共同作用的 结果,也就是由多基因控制的,是这些基因相互作用的结果。